Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP135Q66GS9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP135Q66GS9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP135Q66GS9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms