Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNF123Q5XPI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF123Q5XPI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms