Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUD1Q5VV17 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.7 ms