Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM69BQ5VUD6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM69BQ5VUD6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms