Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RNF20Q5VTR2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms