Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF17Q5VTA0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms