Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CROCCQ5TZA2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms