Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LIN9Q5TKA1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LIN9Q5TKA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LIN9Q5TKA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms