Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO4Q5TGY1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO4Q5TGY1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms