Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGSNQ5TDP6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGSNQ5TDP6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms