Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMSAP1Q5T5Y3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMSAP1Q5T5Y3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMSAP1Q5T5Y3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMSAP1Q5T5Y3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CAMSAP1Q5T5Y3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CAMSAP1Q5T5Y3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CAMSAP1Q5T5Y3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms