Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZFYVE27Q5T4F4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFYVE27Q5T4F4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFYVE27Q5T4F4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms