Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR4Q5GH76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms