Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TAF1BQ53T94 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TAF1BQ53T94 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms