Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL22Q53GT1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms