Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKDCCQ504Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKDCCQ504Y2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms