Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC1Q4ZHG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FNDC1Q4ZHG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FNDC1Q4ZHG4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms