Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP13A4Q4VNC1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms