Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTXN3Q4LDR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTXN3Q4LDR2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms