Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LONRF3Q496Y0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LONRF3Q496Y0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms