Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC153Q494R4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC153Q494R4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms