Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT71Q3SY84 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT71Q3SY84 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms