Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NBPF1Q3BBV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NBPF1Q3BBV0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NBPF1Q3BBV0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms