Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Q1T7F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Q1T7F1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Q1T7F1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Q1T7F1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Q1T7F1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q1T7F1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q1T7F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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