Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
MSMPQ1L6U9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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