Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B3Q16720 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B3Q16720 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
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