Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABRA6Q16445 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GABRA6Q16445 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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