Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC1A5Q15758 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC1A5Q15758 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms