Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TWIST1Q15672 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TWIST1Q15672 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms