Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SF3A1Q15459 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SF3A1Q15459 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SF3A1Q15459 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms