Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEC23AQ15436 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEC23AQ15436 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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SEC23AQ15436 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
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SEC23AQ15436 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEC23AQ15436 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
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