Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NR6A1Q15406 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR6A1Q15406 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms