Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT31Q15323 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT31Q15323 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT31Q15323 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms