Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDK1Q15118 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDK1Q15118 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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