Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KARSQ15046 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KARSQ15046 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KARSQ15046 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KARSQ15046 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KARSQ15046 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KARSQ15046 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KARSQ15046 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KARSQ15046 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KARSQ15046 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KARSQ15046 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KARSQ15046 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KARSQ15046 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KARSQ15046 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KARSQ15046 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KARSQ15046 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KARSQ15046 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KARSQ15046 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KARSQ15046 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KARSQ15046 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KARSQ15046 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KARSQ15046 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KARSQ15046 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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