Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX1Q14549 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GBX1Q14549 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GBX1Q14549 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms