Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CNGB1Q14028 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CNGB1Q14028 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CNGB1Q14028 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
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