Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
CDK13Q14004 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CDK13Q14004 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CDK13Q14004 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
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