Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAPGEF1Q13905 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF1Q13905 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEF1Q13905 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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