Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP1A4Q13733 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP1A4Q13733 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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