Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRQ13535 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRQ13535 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRQ13535 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRQ13535 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRQ13535 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRQ13535 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATRQ13535 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATRQ13535 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATRQ13535 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATRQ13535 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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