Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KLF1Q13351 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLF1Q13351 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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