Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC3Q13217 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC3Q13217 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC3Q13217 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms