Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A2Q13183 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A2Q13183 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A2Q13183 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms