Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHAF1AQ13111 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHAF1AQ13111 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHAF1AQ13111 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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