Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK2Q13002 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIK2Q13002 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIK2Q13002 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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