Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRAF2Q12933 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAF2Q12933 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAF2Q12933 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms