Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 216.61■□□□□ 0.253e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.184e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 HAPLN3-203ENST00000562281 801 ntTSL 315.09■□□□□ 0.014e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.443e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 HAPLN3-202ENST00000558770 3071 ntTSL 211.23□□□□□ -0.614e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 TVP23C-208ENST00000581273 488 ntTSL 36.93□□□□□ -1.34e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.09□□□□□ -1.433e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 51.75□□□□□ -2.133e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.844e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MTSS1-218ENST00000529463 569 ntTSL 49.16□□□□□ -0.944e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 MTSS1-212ENST00000522162 553 ntTSL 45.89□□□□□ -1.474e-7■■■■□ 24.8
ILF3Q12906 ABCB8-213ENST00000482309 1994 ntTSL 218.11■□□□□ 0.494e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-215ENST00000488370 606 ntTSL 316.85■□□□□ 0.294e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-218ENST00000489192 762 ntTSL 516.73■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-205ENST00000466514 2199 ntTSL 216.55■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-207ENST00000469410 523 ntTSL 414.37□□□□□ -0.114e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.184e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-217ENST00000488826 562 ntTSL 313.73□□□□□ -0.214e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-203ENST00000461373 537 ntTSL 413.44□□□□□ -0.264e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-206ENST00000466956 574 ntTSL 413.04□□□□□ -0.324e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-204ENST00000462605 560 ntTSL 412.37□□□□□ -0.434e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-209ENST00000471796 535 ntTSL 412.06□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-216ENST00000488551 552 ntTSL 410.41□□□□□ -0.744e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ABCB8-210ENST00000472698 524 ntTSL 410.18□□□□□ -0.784e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-8■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 26.87□□□□□ -1.314e-8■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-205ENST00000471583 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.755e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-208ENST00000479335 1615 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.95e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.155e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.155e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-204ENST00000469165 1158 ntTSL 37.09□□□□□ -1.275e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-202ENST00000460526 794 ntTSL 37.09□□□□□ -1.275e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-203ENST00000468382 829 ntTSL 56.43□□□□□ -1.385e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-207ENST00000478014 618 ntTSL 36.42□□□□□ -1.385e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-224ENST00000557045 528 ntTSL 36.36□□□□□ -1.395e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.435e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 35.49□□□□□ -1.535e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-213ENST00000492236 417 ntTSL 34.18□□□□□ -1.745e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 44.16□□□□□ -1.745e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 33.89□□□□□ -1.795e-11■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 327.65■■■□□ 2.021e-7■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 AP000561.1-201ENST00000444130 435 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.839e-7■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ALDH18A1-203ENST00000483788 750 ntTSL 319.53■□□□□ 0.721e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 24.7
ILF3Q12906 CCDC144NL-AS1-213ENST00000580278 1819 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 TULP4-207ENST00000620026 680 ntTSL 421.11■□□□□ 0.971e-8■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 FAM162A-203ENST00000477892 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.452e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.418e-11■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-35■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.161e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.995e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.665e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.195e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 PDCD5-201ENST00000221784 558 ntTSL 313.79□□□□□ -0.25e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-209ENST00000608368 551 ntTSL 414.43□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-205ENST00000463912 2382 ntTSL 26.29□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 LUC7L2-207ENST00000498518 2837 ntTSL 23.67□□□□□ -1.821e-6■■■■□ 24.6
ILF3Q12906 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.483e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 IP6K1-208ENST00000498149 687 ntTSL 417.52■□□□□ 0.43e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.043e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.463e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.723e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 PTEN-202ENST00000462694 383 ntTSL 24.51□□□□□ -1.693e-8■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.422e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 219.55■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 518.16■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 517.82■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 215.92■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 210.05□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 59.74□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 59.74□□□□□ -0.852e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 RNASET2-211ENST00000509073 433 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.782e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 AC002480.1-201ENST00000442252 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 24.5
ILF3Q12906 STEAP1B-204ENST00000439708 797 ntTSL 35.05□□□□□ -1.62e-6■■■■□ 24.5
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 137.6 ms