Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCB1Q12824 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMARCB1Q12824 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
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