Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF543Q08ER8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF543Q08ER8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF543Q08ER8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms